南洋商学院
南洋理工大学南洋商学院 一直名列于世界顶尖商学院之列，其卓越的课程和丰富的经营与管理经验使其成为新加坡唯一和亚洲三家之一，同时获得 EQUIS 认证（欧洲管理发展基金会针对工商学院的国际性质量认证体系，是欧洲最严格的质量认证体系）和 AACSB 认证的商学院。
工学院
南洋理工大学的工程学院是全球最大的工程学院之一，分六个学系专注于创新和科技。学院提供多学科的综合性和专业课程，充分照顾到不同学生的学习兴趣及职业目标。除了 12 个学士学位课程外，还设有双学士学位课程、双主修课程、综合课程以及新加坡唯一的宇航工程课程等。
化学与生物医学工程学院
土木与环境工程学院
计算机科学与工程学院
学院
材料科学与工程学院
机械与宇航工程学院
文学院
南洋理工大学的文学院分为黄金辉传播与信息学院、艺术、设计与媒体学院和人文与社会科学学院三大主要院系。
黄金辉传播与信息学院为亚洲最知名的传播教育与研究学府之一，设有 4 年制传播学荣誉学士学位课程，为学生提供坚实的传播理论基础与实用的媒体技巧培训。学生有广泛的机会发展不同的传播兴趣，选择新闻与出版、电子与广播传媒、公众与宣传传播或传播研究为主修课程。毕业生主要服务于媒体和信息业界或修读传播学高级研究课程。
艺术、设计与媒体学院为学生提供发掘与创作美术作品的知识与工具。该院在加强新加坡的创意文化及认同，把新加坡打造为本区域的媒体与创意中心方面，扮演着重要的角色。学院设有纯美术学士学位课程，可供选择的专修领域有六个：数码动画、数码电影制作、摄影与数码影像、互动媒体、产品设计及视觉传播。
人文与社 院的愿景是成为亚洲主要的人文与社会科学学术中心，为知识的开拓与人类生命的进步作出宝贵贡献。与南大的科学与科技相辅相成，学院提供兼具深度与广度的本科教育，并为所有学生提供丰富的文化与智力的激荡。
理学院
南洋理工大学的理学院所提供的物理、数理和生物科学等相关的课程是新加坡唯一的学士荣誉学位课程。其中，生物科学学院开设的生物医学和中医学双学位课程是与北京中医药大学联办。毕业生将获颁南大生物医学理学士荣誉学位以及北京中医药大学的医学中医专业学士学位。
生物科学学院
数理科学院
亚洲环境学院
李光前医学院
李光前医学院是南洋理工大学与伦敦大学帝国学院联办的医科院校，旨在培养新一代的医学专才。开始在 2013 年收生，毕业生在完成为期五年的医学学士学位文凭课程后，将能良好地掌握医学的基础知识，以及跨学科知识如商务管理和科技等。学院以新加坡慈善家李光前命名，旨在成为创新医学教育的未来典范。他们毕业后将获得伦敦大学帝国学院和南洋理工大学内外科医学学士学位文凭，并且具备资格成为 21 世纪新加坡人保健和福利的监护人。
跨学科研究生学院
南洋理工大学的跨学科研究生学院 集中于三个主要科研领域 ，即可持续发展、医疗保健和新型媒体，促进学府在创造各领域高峰的进展。选择跨学科教育的研究生除了修读主要学科的课程，也须选择另一项学科作为副修，进行跨学科研究。跨学科研究生学院在进行博士生研究工作中，寻求借鉴南大各个跨学科部门的实力。跨学科研究生学院以研讨式的教学方式，提供多个互动的机会，旨在培养新一代的博士生。这与海外顶尖学府的最佳实践一致。
国立教育学院
国立教育学院是南洋理工大学的自主学院之一。作为新加坡唯一的师资培训学院，国立教育学院多年来致力为学员提供优质的职前训练与在职教师专业发展培训。同时，也以本身优越的软硬体条件，为新加坡与区域的教育界提供研究咨询服务。
拉惹勒南国际关系学院
院是南洋理工大学一所自主的研究院，集中培养外交与安全事务，以及从事政策相关研究的领袖人才，为来自全世界的研究生提供国际关系的专业教育，并且就新加坡和本区域所面对的传统与非传统安全挑战进行与政策相关及基础性的研究工作。
